凡例十三则
1．此书访辑，知多遗漏，然其诗古文词，鉴论经训，皆宗三教之旨，以垂百世之言，亦涵三宫所云：“《吕祖全书》辑未全，而义则全也”，故曰《全集》。
2．出处显化，凡子虚乌有、院本浮谈之类，皆所不取。兹特取史志记传、道门实录者，以为观鉴。
3．先生法像，见于石刻者甚多，欲尽传之，难以描写。今兹特取立、坐、行、眠，临成四幅，从简赅也。
4．《正讹》、《显迹》、《汇记》诸篇，前后有互见者，其详略却自不同。阅者首尾参观，则先生之实事益见。
5．此书得于他处所刻、黄冠所抄者，类多讹误，惟汪本特为近善。兹刻凡系汪仙所藏，必题“圆通道人藏本”，志自来也。
6．《云水前集》，皆系先生住世时所作，编年纪月，如见平生。其有散见于各省志传者，皆集中之作也，故不注某诗见某志。
7．《云水后集》、《三集》，一系度汪仙时所作，一系住空青时所作，故仍以编年序之，纪神游也。闻他处有先生乩沙，恐其人鬼杂出，难以尽信，间有可信者，则录于《汇记》之内，正集不敢滥收。
8．《玄要篇》诗古、道情，别刻混为一卷，兹照汪仙藏本，分“诗古”为上卷，“道情”为下卷。其不与《云水诗》相参者，《云水》系先生事迹，《玄要》乃先生道言也。
9．《明史·文翰类》所载道家书目，其中有先生《金丹直指》一卷，又《金丹秘诀》一卷，即今《大道论》、《玄机直讲》与《玄要篇》也。又名《节要》，又名《捷要》，俱见《神仙通鉴》。兹照汪仙所藏、先生自订者名之，不复更易。
10．俗刻多讹，传抄多谬，兹集于文义两可者，必为小注存之，以俟阅者去取。
11．句读只用单圈，题义略为疏解，以便阅者豁目。
12．先生仙传医方、河图地理，此皆明所作，别有成书传世，兹不合编，以便求道、求术者，各从所好。
13．此书抄录底本者，嘉州杨建峻、东冈李岱霖、犍为刘光焯、刘光泽也。其同采访者，李迦秀、李朝华、李元瑞、黄令仪、王筠、王琮、胡大文、曾炳元，皆乐山人也。阆中李耀先，与前十三人，共向劝梓。
长乙谨记之，以志同善焉。
附录：凡例十二则
（空青洞天朱道生刊本）
1．此书访辑，知多遗漏，然其诗古文词，鉴论经训，皆宗三教之旨，以垂百世之言，亦涵三宫所云：“《吕祖全书》辑未全，而义则全也”，故曰《全集》。
2．出处显化，凡子虚乌有、院本浮谈之类，皆所不取。兹特取史志记传、道门实录者，以为观鉴。
3．先生法像，见于石刻者甚，欲尽传之，难以描写。今兹特取立、坐、行、眠，临成四幅，从简赅也。
4．《正讹》、《显迹》、《汇记》诸篇，前后有互见者，其详略却自不同。阅者首尾参观，则先生之实事益见。
5．此书得于他处所刻、黄冠所抄者，类多讹误，惟汪本特为近善。兹刻凡系汪仙所藏，必题“圆通道人藏本”，志自来也。
6．《云水前集》皆系先生住世时所作，编年纪月，如见平生。其有散见于各省志传者，皆集中之作也，故不注某诗见某志。
7．《云水后集》、《三集》，一系度汪仙时所作，一系住空青时所作，故仍以编年序之，纪神游也。闻他处有先生乩沙，恐其人鬼杂出，难以尽信，间有可信者，则录于《汇记》之内，正集不敢滥收。
8．此书前刻大板，各部顶批失落者甚多，并且篇页错乱。内有《云水诗集》，难以清正。近有张之洞者，督学四川，捐赀翻刻袖板，校正无讹，亦且便于行箧。凡此刊补遗，尽皆编次其中。
9．此书内有《灵宝毕法》丹经，乃修仙之捷径。凡读此经者，尽心修身，金丹大道有何难哉！
10．《玄要篇》诗古、道情，别刻混为一卷，兹照汪仙藏本，分“诗古”为上卷，“道情”为下卷。其不与《云水诗》相参者，《云水》系先生事迹，《玄要》乃先生道言也。
11．《明史》文翰类所载道书目，其中有先生《金丹直指》一卷，又《金丹秘诀》一卷，即今《大道论》、《玄机直讲》与《玄要篇》也。又名《节要》，又名《捷要》，俱见《神仙通鉴》。兹照汪仙所藏、先生自订者名之，不复更易。
12．此书雕成之后，专望博雅君子，爰仿古人编辑搜轶，补附卷末，再有所得，依此续之。
虚白堂志
（空青洞天朱道生刊本）《丰祖全书》初刊已行海内矣，养生妙道，多具其中。阆中高士朱桐荪，见而悦之，恐其板多经刷印，易于漫漶，乃翻为袖珍板式，以便行箧，且能多印数千部，流传世间，真善举也。又《无根树》有刘、李二注，并附钟辑《灵宝毕法》，系修养延年，阐发玄蕴，更为透彻，亦有大板行世，桐荪见之，必更收入袖板中也。
张三丰先生全集总目
（空青洞天朱道生刊本）
一卷
序 诰 传 仙派 正讹 显迹
二卷
古文 隐鉴
三卷
大道论 玄机直讲 道言浅近
四卷
玄要篇上 玄要篇下 补遗
五卷
云水前集 云水后集 云水三集
六卷
天口篇 训世文
七卷
九皇经 三教经 度人经 菩提经 钟偈
八卷
水石闲谈 古今题赠 隐镜 汇记
《张三丰先生全集》题署
（空青洞天朱道生刊本）
汉嘉长乙山人李西月 重编
张道渊子深氏 敬书
阆中朱道生晚成子 敬刊
侄 瑛春城
朱瓒素园 同校字
男 璜蟠溪